1、等级不同：博物院的规模更大，属国家级博物馆则多是市级。
2、藏品数量不同：博物院的藏品会比博物馆更多，且更珍贵。
3、性质不同：博物馆的职能相对比较单一，主要就是收藏与展出。而博物院除了基本的职能外，往往还常设有专门的文物研究、鉴定研究机构，有专职的研究员团队。
4、建筑文化不同：许多博物院的建筑本身就是“文物”，即使不是老建筑，也是值得欣赏的艺术品。所以博物院本身建筑的文化价值、艺术价值较博物馆更高。
博物院和博物馆的区别是等级规模和藏品不同的区别。博物院等级规模属于国家级，博物馆等级规模属于省市级。博物院藏品巨大，种类多，很多稀世珍品。博物馆的藏品很少，无法与博物院相比。
1、除我国外，其它国家名称及其译名没有“博物院”的概念。如西方媒体评选的世界四大博物馆名称及中文通行译名：法国巴黎卢浮宫（法国国家博物馆）、英国伦敦大英博物馆、美国纽约大都会博物馆和俄罗斯圣彼得堡冬宫/国立艾尔米塔什博物馆。
2、我国《文物保护法》和《博物馆管理条例》只有“博物馆”和“馆藏文物”的提法。我国对博物馆机构的管理区分，只有性质（国有/非国有博物馆）、分类（综合类、历史类、艺术类、科学与技术类）和分级（一二三级）等，而没有区分博物馆和博物院的不同。
3、我国目前称之为“博物院”，且划为国有的一级的博物馆机构有10多家。